Ogniska Chikungunya

Ewolucyjne ogniwa pomiędzy częściowymi sekwencjami E1 z szczepów wirusa Chikungunya. Zmiany nukleotydowe w sekwencjach E1 pokazano wzdłuż gałęzi. Linie przerywane wskazują, że nie znaleziono żadnej zmiany w sekwencji nukleotydowej 199 (pozycje od 271 do 469) wzdłuż gałęzi. Zgłoszone sekwencje z Indii5 były dłuższe, ale nukleotydy na każdym końcu (w pozycjach od 253 do 270 i od 528 do 546) odpowiadają miejscami wiązania starterów łańcuchowych reakcji polimerazy i dlatego prawdopodobnie nie są faktyczną sekwencją izolatu.
W artykule z Perspektywy o wybuchach gorączki chikungunya, Charrel i in. (Wydanie 22 lutego) sugerują, że niedawny wybuch epidemii w Indiach2 mógł być spowodowany przez ten sam szczep wirusa, który spowodował wybuch Oceanu Indyjskiego3. Ostatnie dane nie potwierdzają tej spekulacji.4,5 Opisywana wcześniej mikroheterogenność sekwencji w wirusach powodując wybuch Oceanu Indyjskiego.4 Porównaliśmy sekwencje E1 z wirusami biorącymi udział w ogniskach Indii i Oceanu Indyjskiego (Ryc. 1) .4,5 Szczepy różniły się jedynie zmianą pojedynczego nukleotydu (T321C), która została stwierdzona na całym Oceanie Indyjskim izoluje. Izolaty z Indii zachowały pierwotny nukleotyd T321 obecny we wszystkich innych afrykańskich i azjatyckich szczepach, co sprawia, że jest mało prawdopodobne, że wybuch w Indiach był spowodowany przez szczep pochodzący z wybuchu Oceanu Indyjskiego. Niemniej jednak, w przeciwieństwie do sekwencji ze wszystkich innych dostępnych wirusów chikungunya, izolaty Indii i Oceanu Indyjskiego dzielą dwie zmiany nukleotydów: A306G i C384T. Te wspólne pochodne znaki wskazują na wspólny przodek. Szczep wyizolowany z Yawat w Indiach w 2000 r. Zachował pierwotny nukleotyd w obu pozycjach, ale miał charakterystyczną zmianę T468C, argumentując przeciwko bezpośredniemu związkowi między tym szczepem a szczepem zamieszanym w epidemię indyjską w latach 2005-2006.
Sylvain Brisse, Ph.D.
Isabelle Iteman, Ph.D.
Institut Pasteur, 75724 Paryż, Francja
[email protected] fr
Isabelle Schuffenecker, MD, Pharm.D.
Krajowe Centrum Referencyjne dla Arboviruses, 69007 Lyon, Francja
5 Referencje1. Charrel RN, de Lamballerie X, Raoult D. Chikungunya – globalizacja chorób przenoszonych przez wektory. N Engl J Med 2007; 356: 769-771
Full Text Web of Science MedlineGoogle Scholar
2. Saxena SK, Singh M, Mishra N, Lakshmi V. Odrodzenie wirusa chikungunya w Indiach: pojawiające się zagrożenie. Euro Surveill 2006; 11 (8): E060810.2.
Google Scholar
3. Higgs S. Epidemia Chikungunya w latach 2005-2006 na Oceanie Indyjskim. Vector Borne Zoonotic Dis 2006; 6: 115-116
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
4. Schuffenecker I, Iteman I, Michault A, i in. Mikroewolucja genomu wirusów chikungunya powodująca wybuch Oceanu Indyjskiego. PLoS Med 2006; 3: e263-e263
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
5. Yergolkar PN, Tandale BV, Arankalle VA, i in. Epidemie Chikungunya wywołane przez afrykański genotyp, Indie. Emerg Infect Dis 2006; 12: 1580-1583
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
Obawiam się dokładności artykułu Perspective autorstwa Charrel i in. dotyczące dystrybucji Aedes albopictus w Australii i liczby zgonów przypisywanych chikungunya w ostatnich wybuchach epidemii na wyspach Oceanu Indyjskiego Mapa dołączona do artykułu wskazuje, że A. albopictus jest szeroko rozpowszechniony w Australii. To jest niepoprawne. A. albopictus nie został znaleziony w Australii kontynentalnej.1
W kwietniu 2005 r. A. albopictus został odkryty w cieśninie Torres w Australii.2 Jednak program zwalczania obecnie ogranicza dalszą ekspansję na stały ląd. Mapa nie wskazuje również, że A. albopictus występuje w dużej części zachodniej Indonezji, podczas gdy pokazuje populacje w większości zachodnich Stanów Zjednoczonych.
Jestem również zaniepokojony stwierdzeniem, że chikungunya była zamieszana w 237 zgonów. Narodowy Komitet Arbovirus i Komitet Doradczy ds. Malarii uważa, że wiele danych dotyczących śmierci ludzi przypisywanych wyłącznie chikungunya jest bardzo kontrowersyjnych i nie zostało odpowiednio ocenionych.
Julie Hall, MPH i T.M.
Komitet Konsultacyjny Narodowego Arbovirusa i Malarii, Canberra CT 2601, Australia
julie. [email protected] gov.au
2 Referencje1. Gratz NG. Krytyczna recenzja statusu wektora Aedes albopictus. Med Vet Entomol 2004; 18: 215-227
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
2. Ritchie SA, Moore P, Carruthers M, i in. Odkrycie powszechnej inwazji Aedes albopictus w Cieśninie Torresa w Australii. J Am Mosq Control Assoc 2006; 22: 358-365
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
Odpowiedź
Autorzy odpowiadają: Brisse et al. przyczyniają się do nowego drzewa filogenetycznego, które obejmuje szczepy biorące udział w wybuchach chikungunya w 2005 i 2006 r. Ich dane potwierdzają, że szczepy zamieszane w wybuchy zarówno Oceanu Indyjskiego, jak i Indii pochodzą od wspólnego przodka, który nie został jeszcze zidentyfikowany. Co więcej, pokazują one, że obecny wybuch epidemii indyjskiej wiąże się z odmiennym szczepem niż ten odkryty w Yawat w Indiach w 2000 roku. Sugeruje to, że ogromny wybuch 2005-2006 nastąpił po pojawieniu się nowego wariantu, który następnie ewoluował w Indiach i na Oceanie Indyjskim. .
Hall może słusznie podkreślić, że komar A. albopictus nie ma siedziby w kontynentalnej części Australii. Jednakże ma on siedzibę w regionie Cieśniny Torres w północnej Australii1 i był wielokrotnie identyfikowany w portach australijskich i nowozelandzkich od 20 lat.2,3 Hall jest również zaniepokojony zgłoszoną liczbą zgonów. Liczba zgonów na miesiąc na wyspie Reunion wzrosła o 34% w lutym 2006 r. I 25% w marcu 2006 r. W porównaniu z liczbą w tym samym miesiącu w 2005 r.4. Te zwiększenia stanowią łącznie 170 do 180 dodatkowych zgonów, tylko dla tych 2 miesięcy, a wiele z nich występuje u pacjentów w wieku powyżej 75 lat. Łączna nadwyżka 260 zgonów została zgłoszona przez Francuski Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego4 w celu wybuchu epidemii. Odpowiada to w przybliżeniu 1% wskaźnikowi śmiertelności w szacowanych przypadkach chikungunya (na podstawie badań seropowalenności). Istotnie, wybuch epidemii wiązał się ze znacznym wzrostem śmiertelności i nie zidentyfikowano żadnej innej przyczyny zgonu w tym okresie. Niewiele epidemii znacząco zmieniło wskaźnik śmiertelności w całym kraju. W wybuchu Reunion w 2006 r. Chikungunya była istotną przyczyną śmierci, być może ze względu na wyższy odsetek starszych pacjentów zarażonych podczas tego wybuchu niż podczas poprzednich epidemii.
Remi N Charrel, MD, Ph.D.
Xavier de Lamballerie, MD, Ph.D.
Didier Raoult, MD, Ph.D.
Université de la Mediterranée, 13385 Marsylia, Francja
4 Referencje1. Russell RC, Williams CR, Sutherst RW, Ritchie SA. Aedes (Stegomyia
[hasła pokrewne: pościel elway allegro, zarobki ratownika medycznego, półpasiec objawy zdjęcia ]